Al hacerse cargo del caso, el juez federal Luis Leiva dispuso el 2 de junio de 1999 la captura de diez directivos del Banco Mendoza e imputó a otros cuatro por entender que violaron la ley penal tributaria. Sólo logró detener a dos, Rivarola y Emili (Moneta, Magnaghi y Matas, entre otros, estuvieron prófugos), y más tarde decidió unificar la causa del banco oficial con el privado en tanto que el juez Literas reclamó la competencia del caso.
Leiva con posterioridad, ordenó la detención del tío, socio y padrino de Moneta, Benito Lucini. Pero en diciembre de 1999 fue cuando la Corte decidió que la competencia del caso le correspondía a la Justicia Federal de la Capital Federal. Y entonces, el 13 de ese mes, se otorgó la exención de prisión al banquero.
Para Cobos, la iniciativa para que el gobernador bonaerese Scioli y los intendentes se presenten como candidatos es "una aberración". De Narváez, la UCR, Carrió y Menem también la criticaron duramente. El Gobierno la defiende.
El 9 de abril de 1999 no abrió y entró en proceso de liquidación. Moneta, las denuncias de irregularidades y el intento de refundarlo.